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Abbildung 4.16: Übersicht der Bindetasche von Methylen-H

MPT und F

420

. Die

α, β-Domäne ist in blau, die Helixbündeldomäne in rot und das C-terminale β-Faltblatt in

hellgrün dargestellt. Methylen-H

MPT (grau) ist vornehmlich an die Helixbündeldomäne, F

420

(grün) an die α, β-Domäne gebunden. Ein Loop (α1’ → β1’) des Gegenmonomers (hellblau)

verengt die Bindetasche, deren ungefähre Abmessungen in orange angegeben sind.

Überraschenderweise geht die Bindung der verhältnismäßig sperrigen Moleküle

nicht mit signifikanten Konformationsänderungen einher und stellt somit ein

besonders ausgeprägtes Beispiel für eine vorgegebene Bindetasche dar. Ermöglicht

wird diese Besonderheit durch die vielfältigen Verknüpfungen der exponierten

Bindestelle mit dem Proteininneren. So wird die Innenwand der Bindetasche, an die

sich das Pterin-Imidazolidin-Phenyl-Ringsystem von Methylen-H

MPT anheftet, aus

den Seitenketten der Aminosäurereste Leu125, Met137, Tyr140 and Leu144

gebildet. Diese wiederum sind alle direkt mit dem hydrophoben Innenteil der

helicalen Domäne verbunden, welche über die Wechselwirkungen mit den anderen

Monomeren innerhalb des aus zwölf Helices bestehenden Bündels zusätzlich

stabilisiert wird. Die gegenüberliegende Wand der Bindetasche wird von kurzen

Loops nach den Strängen β1, β2, β3 (Phe67-Gly71) und β4 (Ala94-Asp99) des

starren zentralen β-Faltblatts gebildet. Das Loop-Segment des Gegenmonomers

steht über die Aminosäurereste Asp25, Glu26 and Arg27 in Van-der-Waals-Kontakt

zum Imidazolidin- und Pyrazinring von Methylen-H

MPT und wird durch ein Netzwerk

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