
1 Einleitung
1.5 Ziel der Arbeit
Ziel dieser Arbeit war die strukturelle Charakterisierung der Bindung von H
4
MPT-
Derivaten an zwei Enzyme des methanogenen, CO
2
-reduzierenden
Energiestoffwechselweges. Für die N
5
-Methyl-H
4
MPT:Coenzym M-Methyltransferase
(Mtr) aus M. marburgensis lag bereits ein Protokoll zur Reinigung unter anaeroben
Bedingungen vor (56). Dieses sollte für die aerobe Reinigung vereinfacht und für die
Erfordernisse der zur Strukturbestimmung verwendeten elektronenmikroskopischen
Einzelpartikelmessung optimiert werden. Dazu wurden zwei Strategien gewählt, zum
einen die Präparation des kompletten, acht Untereinheiten umfassenden Komplexes
MtrA-H, zum anderen die Präparation des Enzymkomplexes MtrA-G unter möglichst
vollständiger Abtrennung der Untereinheit MtrH. Der gereinigte Komplex sollte
sodann elektronenmikroskopisch untersucht werden.
Parallel dazu sollten die den Cob(I)amid-Cofaktor bindende Untereinheit MtrA
sowie die H
4
MPT-bindende Untereinheit MtrH in für die Kristallisation und
röntgenkristallographische Untersuchung ausreichender Menge und Qualität
gereinigt werden. Hierfür wurden MtrA und MtrH aus M. jannaschii und M. kandleri
bzw. aus M. marburgensis, M. jannaschii und M. kandleri für die heterologe
Expression in E. coli kloniert, die Expressionsbedingungen optimiert und ein
Reinigungsprotokoll etabliert. Anschließend wurden die Untereinheiten
umfangreichen Kristallisationsversuchen unterzogen.
Als zweites H
4
MPT-bindendes Enzym sollte die F
420
-abhängige N
5
,N
10
-Methylen-
H
4
MPT-Dehydrogenase (Mtd) aus M. kandleri im Komplex mit Substrat (Methylen-
H
4
MPT) und Cosubstrat (F
420
) strukturell charakterisiert werden. Das gereinigte,
rekombinante Enzym wurde mit verschiedenen H
4
MPT- und F
420
-Derivaten
co-kristallisiert und die Struktur röntgenkristallographisch bestimmt. Anhand dieser
Struktur sollte die Bindung von H
4
MPT und F
420
analysiert werden.
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