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Wie bereits in der Einleitung erwähnt, werden die Gene der Hydrogenasen Vhc und
Frc nur bei Selenmangel transkribiert (Berghöfer et al., 1994). In
Expressionsanalysen mittels der 2D-Elektrophorese wurden weitere Proteine
identifiziert, die ebenfalls nur unter Selenlimitierung synthetisiert werden (Niess,
2001). Die Bestimmung der N-terminalen Peptidsequenzen erfolgte von zwei, aus
den Gelen ausgeschnittenen Proteinen. Von einem wurde zudem auch interne
Peptidsequenzen nach Behandlung mit Trypsin ermittelt. Verwandte Proteine
konnten aus den Teilsequenzen zu diesem Protein durch eine Datenbankrecherche
nicht gefunden werden.
Für das andere jedoch wurde ein verwandtes Protein mit unbekannter Funktion und
einer Übereinstimmung der N-terminalen Peptidsequenz von 79% in M. jannaschii
gefunden. Es wird in dieser Arbeit nicht untersucht, da es bei M. jannaschii
vermutlich keine zu M. voltae vergleichbare Anpassung an Selenmangel gibt.
Beispielsweise wächst M. jannaschii im Gegensatz zu M. voltae nicht auf einem
selenarmen Medium (Burggraf et al., 1990; Mukhopadhyay et al., 1999).
5.1 Identifizierung des Gens sdmA
Für weitere Untersuchungen war es notwendig zunächst das Gen des Proteins zu
identifizieren, dessen Funktion in der vorliegenden Arbeit geklärt werden soll.
Anhand der oben erwähnten internen Peptide wurden die heterologen Primer
pep2ufw(sdm) und pep1urv(sdm) zur Ermittlung des Gens a/jointfilesconvert/481994/bgeleitet. Als Matrize
wurde genomische DNA aus M. voltae eingesetzt. Mit den beiden Primern entstand
ein ca. 500 bp großes PCR-Produkt, das nach dem Einsetzen in den Vektor Topo
pCR 2.1 sequenziert wurde. Die Sequenz ist in Abb. 5 dargestellt. Allerdings konnte
der 5´- und 3´-Bereich des Gens über die PCR nicht bestimmt werden. Diese
Sequenzen wurden durch ein Screening einer chromosomaler Phagenbank von
M. voltae und partieller chromosomaler Plasmid-Genbanken über eine
Koloniehybridisierung ermittelt. Eine Übereinstimmung der identifizierten DNA-
Sequenz mit dem ausgeschnittenen Protein wurde durch ein internes Peptid
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